在Excel中预处理数据,以target protein和β-Actin的灰度值为基础,计算相对表达,如图18所示。接着,使用GraphPad,选择“Column”,创建数据表格,如图19。在新建的表格中,如图20所示,为表格命名并整理数据,确保时间和内容清晰,数据按要求粘贴并进行统计分析,如图21和图22。
随着统计方法的普及,不仅统计工作者可以搞统计分析,各行各业的工作者都可以运用统计方法进行统计分析。只将统计工作者参与的分析活动称为统计分析的说法严格说来是不正确的。提供高质量、准确而又及时的统计数据和高层次、有一定深度、广度的统计分析报告是统计分析的产品。
个人认为,其实western是一个半定量的实验,最后的胶片上显示的条带就是给出一个最直观的结果,而对其灰度值的量化不外乎是在肉眼可见的基础上在给出一个数值的参考而已。我们可以在“Image-Invertdata中将图片色彩进行反转,然后便可以用QuantityOne进行分析了.文字注释:QuantityOne提供基本的文字注释功能。
对于一些时间点或者是不同组织蛋白表达量的分析就涉及到量的变化。
灰度值分析自然就成为我们的首选。延伸说一下,免疫组织化学染色(IHC)结果本身为近白色背景、棕黄色阳性表达,这时我们就不能直接用灰度反映阳性表达强弱了,而是积分吸光度,也就是咱们常说的平均光密度(IOD)。如果你真的想用灰度计算IHC结果,显然你需要将图片转为灰度图再计算。此处不表。
Western-blot是一种半定量的检测手段。 个人认为如果要通过灰度值来计算蛋白浓度,那就是和内参来做对比,因为内参的浓度是已知且单一条带的蛋白样品。通过待测样品盒内参样品灰度值做对比可以算出待测样品大概的浓度。
1、多元回归研究一个因变量、与两个或两个以上自变量的回归。亦称为多元线性回归,是反映一种现象或事物的数量依多种现象或事物的数量的变动而相应地变动的规律。建立多个变量之间线性或非线性数学模型数量关系式的统。非参数检验是统计分析方法的重要组成部分,它与参数检验共同构成统计推断的基本内容。
2、可以重新测一下灰度值,调整一下。WB一般是压三张片子,可以用其他压的浅的或者压的深的替换一下当前条带,再测一下灰度。
3、一般分析是用方差分析、T检验。统计分析是指运用统计方法及与分析对象有关的知识,从定量与定性的结合上进行的研究活动。
4、这个很简单啊。你做了一次实验,得到的样本做了一次PCR,得到了一次的相对定量(设对照组为1)。然后重新做实验,再做PCR,又得到一组,这样至少重复3次,就有3组相对定量了。
5、在百度上搜索Image J软件然后下载到电脑上安装完毕。安装好Image J软件后,将你做的WB的片子进行扫描,得到扫描版图片。完成步骤1后,装好Image J软件后,点击软件上方的File,下拉点击Open,将扫描图片拉入进入软件中。接着点击软件上方的Image,下拉第一个是Type,点击,将其改为8-bit。
6、Image J灰度分析/ 首先,打开Image J软件,启动界面如图1所示。选择“File”“Open”,找到你需要分析的Western blot图片,如内参β-ACTIN,如图2所示。将图片转换为8位灰度图,操作路径为“Image”“Type”,如图3所示。接下来,对背景进行统一处理。
在Excel中预处理数据,以target protein和β-Actin的灰度值为基础,计算相对表达,如图18所示。接着,使用GraphPad,选择“Column”,创建数据表格,如图19。在新建的表格中,如图20所示,为表格命名并整理数据,确保时间和内容清晰,数据按要求粘贴并进行统计分析,如图21和图22。
Western blot(WB)的灰度值分析是一种半定量方法,用于显示蛋白丰度的相对变化。这种分析通过比较样本中目标蛋白与其他样本(如对照组或模型组)的信号强度来确定目标蛋白表达量的增加或减少。在WB条带定量中,常用的两种方法是灰度分析和光密度分析。
·把图片转化成灰度图片,一般灰度分析的要求图片8bit就好:Image→Type→8-bit。·消除背景影响:ProcessSubtract Background. 选择50基本可以。
灰度值分析自然就成为我们的首选。延伸说一下,免疫组织化学染色(IHC)结果本身为近白色背景、棕黄色阳性表达,这时我们就不能直接用灰度反映阳性表达强弱了,而是积分吸光度,也就是咱们常说的平均光密度(IOD)。如果你真的想用灰度计算IHC结果,显然你需要将图片转为灰度图再计算。此处不表。
进行选择IOD参数。在工具栏上选择不规则AOI,点击条带中的第一个条带,随后按住Ctrl键点击下一个条带,圈住最后一个条带时点击鼠标右键完成选择。在Count/Size界面中点击CountJ键,软件就会自动对条带进行灰度计算。在Count/Size界面中点击View中的Measurement Data,查看统计结果。
灰度分析是利用软件(一般western的照相软件都带这个功能)按照灰度的高低来定量分析样品中的蛋白表达的高低和差异,以解析度为单位。